1.太平天国运动发生在鸦片战争后，而义和团运动发生在19世纪末。2.太平天国运动有统一的领导、纲领、组织，而义和团无领导、纲领、组织。3.太平天国运动建立了政权，持续时间长达十四年之久，规模巨大。而义和团运动并未建立政权，持续时间短。4.太平天国运动对西方外来思想并无排斥，而义和团运动盲目排外。
太平天国和义和团运动相同点
①领导阶级、运动主体、斗争方式：都是农民阶级领导的以农民群众为主体、以武装斗争为主要形式的农民运动。
②组织形式：都是利用宗教结社形式来发动、组织群众，都具有浓厚的迷信色彩。
③结果：在中外反动势力联合镇压下失败。
④作用：沉重打击了中外反动势力。
都是以农民为主体的运动；都采用暴力斗争的形式；规模影响都很大，都有进步作用；都暴露出农民阶级落后的一面；都在中外反动势力联合镇压下失败。